La gouvernance du pôle Aquanova repose sur un équilibre et une représentation équitable des écosystèmes. Elle regroupe des représentants de toutes les typologies d’acteurs en lien avec le pôle Aquanova : PME, startups, groupes et ETI, aux acteurs de la recherche et de la formation, en passant par des fédérations professionnelles et les pôles ou clusters.